feedburnerにリダイレクトする設定のまま、サイトマップとして
認識させるには「atom.xml」ではなく、「atom.xml?redirect=false」としてあげると
認識すると思います。
参照記事（英語です）：http://labnol.blogspot.com/2007/09/fix-blogger-sitemap-xml-warnings-inside.html
尚、補足ですが、Bloggerのatom.xmlでのサイトマップ登録はデフォルトでは25件までしか対応しませんが、
「atom.xml」を「atom.xml?redirect=false&max-results=500」としてあげると500件まで登録可能です。
500件以上登録したい場合は「atom.xml?redirect=false&max-results=500&start-index=501」とすれば
可能なようです。1000件の場合は「atom.xml?redirect=false&max-results=500&start-index=1000」となります。
参照記事：http://www.kuribo.info/2008/02/google.html
http://www.google.com/support/forum/p/webmasters/thread?tid=3a699b63365561b1&hl=jaより引用
